自贡网记者 卜一珊
8月25凌晨,我们的城市还在熟睡中,自贡市疾控中心却繁忙了起来,一支支队伍迅速整装集结待命。
据通报,我市某区县3名外省返乡人员新冠病毒核酸检测结果为阳性,自贡市疾控中心当即启动了应急快速相应机制,再一次“战备转战时”。
在接到病毒样本后,自贡市疾控中心基因测序小组立即着手开展样本复核工作,确定该样本为阳性并且符合测序条件。随即运用二代、三代全基因组测序技术开展测序工作。
基因测序需要经过核酸提取、目的基因的捕获、扩增、纯化、建库等步骤,这些看似简单的流程,却需要十分精细的操作和计算。经过测序技术人员10多小时,昼夜不眠不休的检测,获得了三代初步测序结果,证实此次三个样本均为奥密克戎BA.2.76变异株,与西藏公布的新冠流行毒株为同一型别。
次日,获得这三个新冠样本二代测序结果,经过比对分析,此次二代测序结果新冠全基因组序列覆盖度达99.75%,均为BA.2.76变异株,结合流行病学调查证实此次疫情为西藏输入病例。
早在2020年新型冠状病毒肺炎疫情刚发生时,自贡疾控中心就组织相关专家讨论防控策略,多次送培专业技术人员前往国家疾控中心、四川省疾控中心和华大智造学习测序与分析技术,积极开展技术、设备、人员储备,同时迅速组织成立测序小组,熟悉相关技术流程,制定操作规程,做好各环节的准备,为我市迅速开展新冠病毒测序分析及溯源工作夯实了基础,并成功应用于2021年8月我市荣县1例无症状感染者复阳疫情和2021年10月我市富顺县1例输入性新冠核酸阳性无症状感染者溯源。
与前几次测序溯源相比,此次测序所获得结果时间缩短至24小时以内(三代测序10小时左右),进一步提升了我市的应急溯源能力。
编辑:余凤
责任编辑:张驰
编审:舒旭晖
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